W artykule opublikowanym w czasopiśmie naukowym Cell przedstawiono analizę ponad 28 tys. próbek mikrobiomu jelitowego pobranych od ludzi z różnych części świata. Liczba znalezionych wirusów była zaskakująco wysoka, były one ponadto bardzo zróżnicowane. Pozyskane dane otwierają nowe możliwości badawcze. Pomogą zrozumieć wpływ wirusów żyjących w jelitach na zdrowie ludzi.
Różnorodność mikrobiomu jelitowego
Ludzkie jelita to środowisko niezwykle zróżnicowane pod względem biologicznym. Oprócz bakterii żyją tam również setki tysięcy wirusów zwanych bakteriofagami, które mogą zakażać bakterie.
Brak równowagi w naszym mikrobiomie jelitowym może przyczyniać się do chorób, takich jak nieswoiste zapalenie jelit, alergie i otyłość. Jednak, jeśli chodzi o zdrowie i choroby, stosunkowo niewiele wiadomo na temat roli bakteriofagów, które zakażają bakterie.
Korzystając z metody sekwencjonowania DNA zwanej metagenomiką, naukowcy z Wellcome Sanger Institute i EMBL European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) zbadali i skatalogowali gatunki wirusów znajdujących się w ponad 28 tys. metagenomach ludzkiego jelita i blisko 3 tys. genomach izolatów bakteryjnych wyhodowanych na podstawie ludzkiego jelita. Zidentyfikowano w ten sposób ponad 140 tys. gatunków wirusów żyjących w ludzkich jelitach. Ponad połowa z nich nie była wcześniej znana.
Poznawanie bakteriofagów
Dr Alexandre Almeida z Wellcome Sanger Institute powiedział:
– Ważne jest, aby pamiętać, że nie wszystkie wirusy są szkodliwe, ale stanowią integralny składnik ekosystemu jelit. Po pierwsze, materiał genetyczny większości wirusów, które znaleźliśmy, różni się od patogenów znanych większości ludzi, takich jak SARS-CoV-2 lub Zika, które są wirusami RNA Po drugie, próbki te pochodziły głównie od zdrowych osób, u których nie występowały żadne określone choroby. To fascynujące widzieć, ile nieznanych gatunków żyje w naszych jelitach i próbować rozwikłać związek między nimi a ludzkim zdrowiem.
Wśród dziesiątek tysięcy odkrytych wirusów zidentyfikowano nowy, bardzo rozpowszechniony klad – grupę wirusów uważanych za mających wspólnego przodka, którą autorzy określają jako gubafag. Okazało się, że jest to drugi najbardziej rozpowszechniony klad wirusów w ludzkim jelicie, po kladzie odkrytym w 2014 roku.
Oba te klady wydają się infekować podobne typy bakterii jelitowych człowieka, ale bez dalszych badań trudno jest dobrze poznać funkcje nowo odkrytego gubafaga.
Dr Trevor Lawley, starszy autor badania z Wellcome Sanger Institute, powiedział:
– Badania bakteriofagów przeżywają obecnie renesans. Ten wysokiej jakości katalog wirusów jelitowych pojawił się we właściwym czasie i posłużyc do przyszłych badań nad wirusami.
Czytaj też:
Jak dieta z dzieciństwa wpływa na naszą przyszłość? Nowe ustalenia naukowcówCzytaj też:
4 rzeczy, które możesz zrobić, aby poprawić swoją odpowiedź immunologiczną na szczepionkę COVID19Czytaj też:
Dzięki tym 3 prostym sposobom zadbasz o zdrowie swoich jelit