Naukowcy z wydziału medycyny University of British Columbia przeprowadzili pierwszą na świecie analizę strukturalną białka kolców wariantu Omikron na poziomie molekularnym. Praca ujawniła, w jaki sposób silnie zmutowany wariant Omikron przyłącza się do ludzkich komórek i je infekuje. Badania przeprowadzono przy użyciu mikroskopii krioelektronowej.
Białko kolczyste wariantu Omikron
Kolce znajdujące się na zewnątrz powierzchni SARS-CoV-2, umożliwiają mu wnikanie do ludzkich komórek. Wariant Omikron ma dodatkowe 37 mutacji w swoim białku kolczastym — trzy do pięciu razy więcej niż poprzednie warianty.
Analiza strukturalna wykazała, że kilka mutacji (R493, S496 i R498) tworzy nowe mostki solne i wiązania wodorowe między białkiem kolczastym a receptorem komórki ludzkiej znanym jako ACE2. Naukowcy doszli do wniosku, że te nowe wiązania wydają się zwiększać siłę, z którą wirus przyczepia się do ludzkich komórek – podczas gdy inne mutacje (K417N) zmniejszają siłę tego wiązania. Dalsze eksperymenty wykazały, że białko Omikronu wykazuje zwiększone unikanie przeciwciał.
„Warto zauważyć, że Omikron w mniejszym stopniu unikał odporności wytworzonej przez szczepionki w porównaniu z odpornością na naturalną infekcję u nieszczepionych pacjentów. Sugeruje to, że szczepienia pozostają naszą najlepszą obroną przed wirusem” – powiedział główny autor, dr Sriram Subramaniam, profesor na Wydziale Biochemii i Biologii molekularnej.
Na podstawie zaobserwowanego wzrostu powinowactwa wiązania naukowcy uznali, że mutacje białek kolców są prawdopodobnie czynnikami przyczyniającymi się do zwiększonej przenoszenia wariantu Omikron.
Zespół badawczy wykorzysta tę wiedzę, aby wesprzeć rozwój skuteczniejszych terapii. „Zrozumienie struktury molekularnej wirusowego białka kolca jest ważne, ponieważ pozwoli nam w przyszłości opracować skuteczniejsze terapie przeciwko Omikronowi i pokrewnym wariantom” – dodał dr Sriram Subramaniam.
Czytaj też:
Zidentyfikowano wariant genu, który chroni przed COVID-19Czytaj też:
Prof. Parczewski stanowczo przestrzega przed „Covid party” i maseczkami z filtrem